惠东县环境保护监察大队
主要任务：受委托监督检查环境法律、法规的执行情况；调查环境污染事故和环境污染纠纷并参与处理；具体实施国家的排污收费制度。
惠东县环境保护监测站
主要任务：从事辖区域内的环境质量监测、污染源监督监测、科研性监测和社会服务性监测等工作，并根据环境保护法行政主管部门的授权参与技术监督管理工作。
惠东县环境科学研究所
主要任务：负责组织我县环境保护科研和环境影响评价工作，制订组织实施我县环境保护科技发展规划；组织申报国家和地方重大环境保护课题，管理我县环境科技成果和环境保护新技术、新工艺的引进工作；组织我县环境保护设备的质量监督、认证等工作；为我县环境管理、环境建设提供环境科技和产业服务。
惠东县环境技术中心
主要任务：负责组织环境影响评价大纲和环境影响报告书的技术评审；负责环保资质审查与环保工程招（投）标；负责组织环境保护工程方案技术审查；负责组织环境保护工程技术监理。
惠东县固体废物管理站
主要任务：负责组织实施全县固体废物污染环境防治规划制度、规定；负责全县工业固体废物的申报登记工作；对全县危险废物污染环境防治及进口废物实施统一监督管理；推广先进的固体废物污染防治技术和普及固体废物防治的科学知识。
惠东县环境信息服务中心
主要任务：负责县环保系统计算机及设备的购置、维护；负责县环保系统应用软件的开发、维护及管理；负责县环境保护局自主网站和网页的建设、开发、信息发布与维护；负责全县环境统计工作。
惠东县水质净化中心
主要任务：负责县城污水处理厂的筹建、运行等日常工作。
惠东县环境保护局吉隆环境保护所
主要任务为：主要负责吉隆、黄埠和盐洲三镇的监督检查环境法律、法规的执行情况，调查环境污染事故和环境污染纠纷并参与处理，具体实施国家的排污收费制度。
